Firmy farmaceutyczne każdego dnia zmuszone są do zachowywania danych pochodzących z nadzoru nad bezpieczeństwem farmakoterapii. Dane te powinny być przechowywane w ustrukturyzowanym formacie i przetwarzane zgodnie ze zdefiniowanym procesem pracy mieszczącym się w bezpiecznym i zweryfikowanym środowisku. Liczba danych, które należy zebrać podlega ciągłemu rozrostowi (należy wziąć pod uwagę na przykład ilość ADR dotyczących szczepionek), a wymagania dotyczące ich postępowania są coraz bardziej wymagające.
Producenci baz danych dotyczących nadzoru nad bezpieczeństwem farmakoterapii coraz bardziej się rozwijają, aby ich produkty były sprawne, bezpieczne i zgodne z takimi wymogami. Dane powinny być ustrukturyzowane w sposób umożliwiający ich pózniejsza analizę w zbiorczych raportach oraz zastosowanie działań majacych za zadanie wykrywanie problematycznych zagadnień przez samą firmę i właściwe organy regulatorowe.
Firma musi być zatem w stanie nadążyć za wciąż zmieniającymi się oraz aktualizowanymi wymaganiami, wybierając przy tym narzędzia i dostawców, którzy najlepiej odpowiadają jej wewnętrznym potrzebom, ale jednocześnie nadążają nad wszelkimi zmianami oraz nowelacjami prawnymi.
Wśród największych wyzwań stojących przed poprawnym działem nadzoru nad bezpieczeństwem farmakoterapii w tym okresie są: